Segmentierung von Makrophagen in Fluoreszenzbildern mittels Fast Marching Level Set Verfahren
Abstract
Die Erkennung von mikrobiellen Gefahrensignalen durch Makrophagen führt zu ausgeprägten Veränderungen des Zytoskeletts. Die daraus resultierende morphologische Veränderung (Spreading) führt zur Variation der Kontaktfläche zwischen Zellen und Oberflächenmaterial. Bisher wird die Vermessung durch manuelle Annotation einer jeden einzelnen Zelle durchgeführt. Dieser sehr zeitaufwendige Schritt soll durch den Einsatz von semi-automatischen Werkzeugen unterstützt und beschleunigt werden. Hierfür wird ein multimodales Segmentierungsverfahren erstellt, das mittels erweiterter Wasserscheidentransformation eine Segmentierung der Zellkerne in DAPI Färbung erstellt. Diese Information über die Zellkerne wird als Initialisierung für ein Fast Marching Level Set Verfahren verwendet um mittels Anti-CD11b-APC gefärbte Makrophagen zu segmentieren. Dabei zeigt sich dass durch den multimodalen Ansatz gute Segmentierungsergebnisse auch bei konfluenten Zellbildern möglich sind.
