Fraunhofer-Gesellschaft

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Hier finden Sie wissenschaftliche Publikationen aus den Fraunhofer-Instituten.
20132D meets 4G: G-quadruplexes in RNA secondary structure prediction
Lorenz, R.; Bernhart, S.H.; Qin, J.; Höner zu Siederdissen, C.; Tanzer, A.; Amman, F.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2013Computational design of RNAs with complex energy landscapes
Höner zu Siederdissen, C.; Hammer, S.; Abfalter, I.; Hofacker, I.L.; Flamm, C.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2013Evolution of metabolic networks: A computational frame-work
Flamm, C.; Ullrich, A.; Ekker, H.; Mann, M.; Högerl, D.; Rohrschneider, M.; Sauer, S.; Scheuermann, G.; Klemm, K.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2011Animal snoRNAs and scaRNAs with exceptional structures
Marz, M.; Gruber, A.R.; Siederdissen, C.H.Z.; Amman, F.; Badelt, S.; Bartschat, S.; Bernhart, S.H.; Beyer, W.; Kehr, S.; Lorenz, R.; Tanzer, A.; Yusuf, D.; Tafer, H.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2011RNAcode: Robust discrimination of coding and noncoding regions in comparative sequence data
Washietl, S.; Findeiß, S.; Müller, S.A.; Kalkhof, S.; Bergen, M. von; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.; Goldman, N.
Zeitschriftenaufsatz
2011ViennaRNA Package 2.0
Lorenz, R.; Bernhart, S.H.; Höner zu Siederdissen, C.; Tafer, H.; Flamm, C.; Stadler, P.F.; Hofacker, I.L.
Zeitschriftenaufsatz
2010Bcheck: A wrapper tool for detecting RNase P RNA genes
Yusuf, D.; Marz, M.; Stadler, P.F.; Hofacker, I.L.
Zeitschriftenaufsatz
2010Nematode sbRNAs: Homologs of vertebrate Y RNAs
Boria, I.; Gruber, A.R.; Tanzer, A.; Bernhart, S.H.; Lorenz, R.; Mueller, M.M.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2010RNAsnoop: Efficient target prediction for H/ACA snoRNAs
Tafer, H.; Kehr, S.; Hertel, J.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2008Arthropod 7SK RNA
Gruber, A.R.; Kilgus, C.; Mosig, A.; Hofacker, I.L.; Hennig, W.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2008Folding kinetics of large RNAs
Geis, M.; Flamm, C.; Wolfinger, M.T.; Tanzer, A.; Hofacker, I.L.; Middendorf, M.; Mandl, C.; Stadler, P.F.; Thurner, C.
Zeitschriftenaufsatz
2008Invertebrate 7SK snRNAs
Gruber, A.R.; Koper-Emde, D.; Marz, M.; Tafer, H.; Bernhart, S.; Obernosterer, G.; Mosig, A.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.; Benecke, B.-J.
Zeitschriftenaufsatz
2008Small ncRNA transcriptome analysis from Aspergillus fumigatus suggests a novel mechanism for regulation of protein synthesis
Jochl, C.; Rederstorff, M.; Hertel, J.; Stadler, P.F.; Hofacker, I.L.; Schrettl, M.; Haas, H.; Hüttenhofer, A.
Zeitschriftenaufsatz
2008SnoReport: Computational identification of snoRNAs with unknown targets
Hertel, J.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2008Translational control by RNA-RNA interaction: Improved computation of RNA-RNA binding thermodynamics
Mückstein, U.; Tafer, H.; Bernhart, S.H.; Hernandez-Rosales, M.; Vogel, J.; Stadler, P.F.; Hofacker, I.L.
Konferenzbeitrag
2007RNA maps reveal new RNA classes and a possible function for pervasive transcription
Kapranov, P.; Cheng, J.; Dike, S.; Nix, D.A.; Duttagupta, R.; Willingham, A.T.; Stadler, P.F.; Hertel, J.; Hackermüller, J.; Hofacker, I.L.; Bell, I.; Cheung, E.; Drenkow, J.; Dumais, E.; Patel, S.; Helt, G.; Ganesh, M.; Ghosh, S.; Piccolboni, A.; Sementchenko, V.; Tammana, H.; Gingeras, T.R.
Zeitschriftenaufsatz
2007Structured RNAs in the ENCODE selected regions of the human genome
Washietl, S.; Pedersen, J.S.; Korbel, J.O.; Stocsits, C.; Gruber, A.R.; Hackermüller, J.; Hertel, J.; Lindemeyer, M.; Reiche, K.; Tanzer, A.; Ucla, C.; Wyss, C.; Antonarakis, S.E.; Denoeud, F.; Lagarde, J.; Drenkow, J.; Kapranov, P.; Gingeras, T.R.; Guigo, R.; Snyder, M.; Gerstein, M.B.; Reymond, A.; Hofacker, I.L.; Stadler, P.F.
Zeitschriftenaufsatz
2006Thermodynamics of RNA-RNA binding
Mückstein, U.; Tafer, H.; Hackermüller, J.; Bernhart, S.H.; Stadler, P.F.; Hofacker, I.L.
Zeitschriftenaufsatz